Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d2Q6PHS9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms