Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms