Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HltfQ6PCN7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms