Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp49Q6P9L4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms