Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Smchd1Q6P5D8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smchd1Q6P5D8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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