Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms