Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms