Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rprd2Q6NXI6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms