Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SphkapQ6NSW3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms