Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms