Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Krt77Q6IFZ6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Krt77Q6IFZ6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Krt77Q6IFZ6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Krt77Q6IFZ6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Krt77Q6IFZ6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt77Q6IFZ6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Krt77Q6IFZ6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Krt77Q6IFZ6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Krt77Q6IFZ6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt77Q6IFZ6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms