Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms