Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms