Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC080695Q66JY9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC080695Q66JY9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms