Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Supt6hQ62383 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt6hQ62383 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms