Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms