Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms