Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttf1Q62187 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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