Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sema4aQ62178 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema4aQ62178 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sema4aQ62178 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sema4aQ62178 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema4aQ62178 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sema4aQ62178 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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