Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsx2Q61412 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms