Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2bQ61313 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms