Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ncor1Q60974 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ncor1Q60974 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ncor1Q60974 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ncor1Q60974 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ncor1Q60974 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ncor1Q60974 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ncor1Q60974 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ncor1Q60974 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ncor1Q60974 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms