Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms