Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms