Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RelnQ60841 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RelnQ60841 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms