Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms