Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms