Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Xrcc1Q60596 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Xrcc1Q60596 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Xrcc1Q60596 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Xrcc1Q60596 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Xrcc1Q60596 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Xrcc1Q60596 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Xrcc1Q60596 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Xrcc1Q60596 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Xrcc1Q60596 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms