Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myh1Q5SX40 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Myh1Q5SX40 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms