Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AbrQ5SSL4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms