Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf12Q5SPL2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf12Q5SPL2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms