Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlha9Q5RJB0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 285.6 ms