Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col27a1Q5QNQ9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms