Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms