Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms