Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ecm2Q5FW85 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms