Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfmbt2Q5DTW2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms