Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms