Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5935Q497S0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5935Q497S0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms