Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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