Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fam220aQ3ZN08 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms