Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg1lQ3V384 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms