Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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