Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc9Q3V038 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc9Q3V038 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc9Q3V038 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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