Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms