Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms