Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms