Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rmi2Q3UPE3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms