Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms