Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms